马库什通式化合物是化学领域常见的概括性撰写方式，其根本目的是解决特定化合物发明创造的平行方案拓展保护，最为典型的就是小分子药物化合物的马库什撰写。因此，马库什通式化合物专利申请，通常不要求申请人完成马库什通式化合物中全部的化合物合成及实验研究。
基于这样的审查要求，马库什化合物撰写具有一定的灵活性和规范性。专利局通常会允许申请人基于说明书具体实施例给定的实验数据，根据药物化合物活性发挥基本原理，做适当的上位概括。进而，使申请人获得略大于实验研究具体化合物的保护范围，以更好的保护申请人利益，匹配其创新贡献价值，补偿药物研发成本，促进医药企业加强创新研发。
但是，就马库什通式化合物上位概括的范围，常常是发明人和审查员争议最大的地方，也是代理师撰写中最应该注意的关键技术点。这其中特别需要关注的是发明人已经完成了哪些化合物的合成及活性验证，只有厘清发明人已经完成的创造性贡献，才能精准把握通式化合物发挥活性作用的根本原理，进而概括得出最恰当的保护范围，满足《专利法》第26条第3款规定。
关于马库什通式化合物的撰写，既要注重权利要求书概括适当的保护范围，也要注意说明书公开内容对于权利要求书的支撑。
首先，是技术问题的撰写。
说明书中背景技术的撰写包括背景技术的介绍，技术问题的引入。代理师可以引用现有技术学术期刊报道，或者综述性文献的介绍，以帮助本领域技术人员或审查员快速理解本发明要解决的问题。
然后，是说明书技术方案的撰写。
说明书应当指出解决技术问题所采用的方案，这就涉及到化合物的通式结构。马库什通式化合物的母核是发明人提出的对于治疗疾病发挥作用至关重要的核心结构。对于其上的取代基，一定要概括恰当，不得出现基团连接不符合化学领域常识、违犯价态理论的情况。此外，某些取代基的位置对于化合物的活性也具有非常大的影响，必要的时候进行多层次多层级的概括，分别将不同的取代位置纳入优选保护范围，以增强专利的修改可能性，提高专利后续审查答复或无效过程中的灵活性。当然，相应的连接位置优选范围，还需要通过不同的表征方式进行验证，包括质谱、核磁、红外、紫外光谱、凝胶色谱等表征方法，以更好的验证不同连接位置的化合物被合成得到。
马库什通式化合物保护范围，要注意纳入概括范围的化合物和具体实验资料记载的化合物结构的相似性，只有本领域技术人员能够合理推断/预期具有相同活性的相似化合物，才能获得专利保护。考虑化合物相似性的时候，不能脱离技术问题谈结构相似性，如果研究是基于现有技术进行较小改进得出的方案，其相似性概括的范围不宜过大。通常认为化合物酯化、成盐等具有结构相似性。
化学领域通常认为不同链长的烷基是结构相似的，链长差异越小其化学性质越相似。但当涉及空间构型的时候，则可能认为不同链长的烷基相似性较低。具体到不同案例中，需要结合实验验证具有活性的化合物的结构进行分析，根据本领域普通技术人员的一般认知，合理推导出相似化合物。
然后，是说明书技术效果的撰写。
专利审查要求申请提出的时候，必须提供马库什化合物具有治疗疾病潜力的实验数据，可以是细胞实验，也可以是动物实验，通常是两者的结合，具有一定的层次过度关系。
鉴于小分子药物化合物发挥药物活性作用具有极大的不可预见性，必须通过特定的细胞实验、动物实验才能确认其具有特定疾病治疗潜力。所以，相关的细胞实验、动物实验，是为了证实合成得到的相应化合物具备治疗特定疾病的潜力，具有开发成为创新化药的前景。这种药物活性验证实验，是马库什通式化合物具有创造性的重要证据，药物活性实验必须是逻辑严谨，不存在瑕疵的，否则可能无法购成充要的创造性证明作用。
另外，在药物化合物研究过程中，还可以开展活性机理研究，活性机理研究既可以帮助本领域技术人员或审查员更好的确认发明的创造性贡献，也可以帮助药物开发技术的更好的发展，也就是专利法第一条所指出的为了促进科学技术进步。
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参考资料：
《化学领域 发明专利申请的审查与申请文件撰写精要》，崔军著，2022.